Вероятно от Warner Bros не са и очаквали, че сред критиките за „Хари Потър и Нечистокръвния принц” ще има и такава от страна на Ватикана. L'Osservatore Romano, официалното издание на Светия Престол, приема филма  и поздравява екипа му, като счита, че това е най-добрата екранизация по сагата досега. Положителните критики съдържат хвалебствия за посланието на филма, за ясното разграничаване на добро и зло и за „правилния баланс”  при представянето на любовните отношения между младежите. Според вестника във филма липсвало обаче "по-експлицитно позоваване на трансцедентното”.  Тази положителна критика за филма се появява след предполагаемите  изказвания на Бенедикт ХVІ по темата Хари Потър още от времето, когато бе кардинал, и които не бяха много благоприятни. Според журналистка, тогавашният кардинал обвинявал Хари Потър, че взривява християнството; от Ватикана винаги са отричали тази информация. Факт е обаче, че Роулинг преди време отказа покана от страна на Ватикана за някаква тяхна конференция.